发现与 Biology 相关的最受欢迎的开源项目和工具，了解最新的开发趋势和创新。
让深度学习惠及药物研发、量子化学、材料科学和生物学
计算神经科学领域的学校和研究人员名单
Implementation of Alpha Fold 3 from the paper: "Accurate structure prediction of biomolecular interactions with AlphaFold3" in PyTorch
使用PyTorch实现论文“AlphaFold3：精确预测生物分子相互作用的结构”中描述的AlphaFold3模型。
一个基于PyTorch和TorchDrug的深度学习库，用于药物对评分（KDD 2022）。
Chainer化学：生物学和化学领域深度学习的库
用于科学机器学习 (SciML) 的化学反应网络与系统生物学接口。该接口基于开源软件，具有高性能、GPU 并行化和 O(1) 复杂度的求解器。
单细胞分析深度学习库
几何扩散模型GeoDiff用于分子构象生成的实现（ICLR 2022）
DANCE：一个用于单细胞分析的深度学习库和基准平台
基于遗传模拟退火算法的蛋白质-蛋白质、蛋白质-肽段和蛋白质-DNA对接框架
一个丰富的AI资源库，包含书籍、课程、论文、指南、文章、教程、笔记、AI领域最新进展等
BioReason: Incentivizing Multimodal Biological Reasoning within a DNA-LLM Model
生物学深度学习：十个快速技巧
一种用于三维分子生成和优化的几何完备扩散生成模型（发表于《自然-通讯化学》）
基于深度学习的免疫荧光多重成像分析技术用于免疫组化图像定量 (DeepLIIF) (https://deepliif.org) [发表在《自然·机器智能》(Nature Machine Intelligence'22)、《计算机视觉与模式识别》(CVPR'22)、《医学图像计算与计算机辅助干预》(MICCAI'23)、《组织病理学》(Histopathology'23) 和《医学图像计算与计算机辅助干预》(MICCAI'24) 等期刊]
（NeurIPS 2022细胞分割挑战赛冠军）开源代码：用于多模态显微镜图像的“MEDIAR：数据中心和模型中心方法的和谐统一”
核糖核酸（RNA）语言模型
BioDynaMo是一个高性能、模块化的基于智能体的仿真平台。
用于从头分子生成的混合连续/分类流匹配模型
